Pembelajaran mendalam memecahkan dokteras metalloprotein—titik buta dalam penemuan obat Metalloprotein ada di mana-mana dalam biologi - metalloproteinase matriks pada kanker, superoksida dismutase dalam neurodegenerasi, endonuklease dalam replikasi virus. Mereka adalah target obat yang penting, namun alat komputasi berjuang dengan mereka. Masalahnya: ion logam mengadopsi geometri koordinasi yang beragam dengan preferensi ikatan yang fleksibel dan efek polarisasi yang kuat yang tidak dapat ditangkap oleh fungsi penilaian konvensional. Sebagian besar alat docking mengabaikan logam sepenuhnya atau terbatas pada sistem seng saja. Hui Zhang dan rekan penulis memperkenalkan MetalloDock, kerangka kerja docking pembelajaran mendalam pertama yang dibangun khusus untuk metalloprotein. Inovasi utamanya adalah strategi generasi autoregresif yang dimulai dari pusat logam, pertama-tama memprediksi atom ligan mana yang berkoordinasi dengan logam (atom donor), kemudian membangun sisa molekul ke luar mengikuti topologi kovalen. Kendala sadar fisika memastikan geometri koordinasi yang realistis di seluruhnya. Pada tolok ukur 8.836 kompleks metalloprotein-ligan yang mencakup Zn²⁺, Mg²⁺, Ca²⁺, Mn²⁺, Fe²⁺, dan Co²⁺, MetalloDock mencapai 78,6% keberhasilan docking—mengungguli AlphaFold3, Glide, dan semua metode teruji lainnya. Ini memprediksi atom donor dengan akurasi 88,9% dan mereproduksi jarak koordinasi dalam 0,12 Å dari struktur kristal. Tes nyata: eksperimen prospektif. Skrining virtual terhadap PSMA mengidentifikasi dua inhibitor baru (IC₅₀ = 0,22–0,38 μM). Desain rasional yang menargetkan influenza PA endonuklease—enzim mangan binukklear yang menantang—menghasilkan inhibitor dengan IC₅₀ serendah 191 nM. Pesannya: koordinasi logam telah menjadi titik buta yang terus-menerus dalam penemuan obat komputasi. Dengan membangun fisika priors langsung ke dalam arsitektur, pembelajaran mendalam akhirnya dapat mengatasi masalah ini — membuka metaloenzim ke penyaringan throughput tinggi yang sama yang mengubah kelas target lainnya. Kertas: